encode 접속기 다운로드

국립 인간 게놈 연구소 [U41 HG006992]. 오픈 액세스 요금에 대한 자금 조달: 건강의 국립 연구소. 가장 간단한 방법은 메모리에 다운로드하고 BASE64 인코딩 된 문자열로 저장되며 응답 데이터가 작을 때 유용합니다. 권한 부여에 관해서, 권한 부여 토큰을 사용할 수 있습니다 뿐만 아니라,이 패키지는 자동으로 axios 및 가져오기와 같은 일반 js 요청에 의해 생성 된 쿠키를 전달합니다. 따라서 기존 쿠키 기반 방법을 사용하여 사용자에게 권한을 부여하려는 경우 이 패키지가 작동하기 전에 아무 작업도 수행할 필요가 없습니다. 아무 일도 일어나지 않으면 GitHub 데스크톱을 다운로드하고 다시 시도하십시오. 우리는 NCBI에서 GEO와 협력하여 바이오 샘플 스키마를 바이오 샘플 표준(www.ncbi.nlm.nih.gov/biosample)(11,23)에 매핑했습니다. 현재, 우리는 단순히 자신의 데이터베이스에 이러한 데이터를 가져 오기뿐만 아니라, 더 큰 과학 커뮤니티에 ENCODE 컨소시엄에 의해 생성 된 최신 데이터에 대한 액세스를 제공하기 위해 두 데이터베이스를 주기적으로 동기화하는 방법으로 노력하고 있습니다. Maven 또는 플러그인의 개발 버전을 빌드 하려는 경우, Maven 스냅숏 저장소에 액세스 해야 할 수 있습니다. `방법` 섹션에는 컨소시엄에서 정의한 데이터 표준, 소프트웨어, 분석 파이프라인 및 실험 지침에 대한 정보가 포함되어 있습니다. ENCODE 컨소시엄은 실험 방법과 계산 분석 모두에 대한 품질 및 절차에 대한 내부 표준을 개발합니다. 현재 표준 및 지침은 포털과 이전 버전이 포함된 아카이브에서 구할 수 있습니다.

또한 이러한 데이터 집합의 분석에는 다양한 소프트웨어가 사용됩니다. 투명성을 향상시키기 위해 ENCODE 포털은 ENCODE 프로젝트 분석에 사용되는 소프트웨어의 소스 코드에 대한 버전 정보 및 링크를 호스팅합니다. 목표는 원하는 경우 커뮤니티의 모든 사람이 쉽게 분석을 반복 할 수 있도록 충분한 정보를 제공하는 것입니다. ENCODE 컨소시엄은 또한 다양한 분석의 원시 시퀀싱 데이터를 매핑하고, 매핑에서 시각화 가능한 신호 파일을 생성하고, 정량화 또는 부호 를 생성하는 균일한 분석 파이프라인을 개발하고 있습니다. 이러한 파이프라인의 요약은 일반 사양과 함께 `파이프라인` 페이지에서 연결됩니다. `ENCODE 정보` 섹션에서는 이 사이트에서 발견된 다양한 실험에 대한 컨텍스트를 제공하여 프로젝트 개요, 모든 뉴스 항목에 대한 액세스 및 다른 사이트의 데이터 액세스에 대한 정보를 제공합니다. 이 섹션에는 ENCODE 데이터를 사용하거나 ENCODE 데이터를 만드는 데 사용되는 방법에 대한 참조인 선별된 출판물 컬렉션을 탐색하는 데 대한 안내 항목을 제공하는 `출판물` 페이지도 있습니다. 마지막으로 `도움말` 메뉴에는 다양한 사용자 환경을 용이하게 하기 위한 다양한 도움말 문서와 자습서가 있습니다. 이 섹션에는 REST API 프로그래밍 방식 다운로드를 사용하여 UI에서 데이터를 탐색하는 방법에 대한 지침이 포함되어 있습니다. 이러한 복제된 실험 집합 중 하나에 대해 실험의 모든 세부 정보와 데이터를 수집하는 동적으로 생성된 페이지가 있습니다.

이 페이지는 분석 세부 사항, 프로토콜 문서, 세부 정보 복제, 파일 목록 및 데이터 파일의 출처를 표시하는 대화형 그래프(가능한 경우)의 다섯 가지 섹션으로 나타냅니다. 분석 세부 사항 및 프로토콜 문서는 실험을 완전히 컨텍스트화하고 해석 및 복제에 필요한 중요한 세부 정보를 제공하기 위해 구조화되고 구조화되지 않은 메타데이터의 혼합물을 제공합니다(그림 3A 및 B). 복제 섹션은 실험의 복제 구조에 대한 통찰력을 제공하기 위한 것입니다(그림 3C). 대부분의 ENCODE 실험에 대한 표준 복제 구조는 실험당 2개의 생물학적 복제본(15)이다. 그러나 포털은 복제 구조의 변형을 처리할 수 있을 만큼 유연합니다.